Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC10P48553 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TRAPPC10P48553 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC10P48553 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC10P48553 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms