Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS9P46781 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS9P46781 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS9P46781 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS9P46781 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS9P46781 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS9P46781 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS9P46781 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS9P46781 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS9P46781 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS9P46781 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS9P46781 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS9P46781 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS9P46781 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS9P46781 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS9P46781 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS9P46781 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS9P46781 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS9P46781 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS9P46781 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS9P46781 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS9P46781 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS9P46781 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS9P46781 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS9P46781 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS9P46781 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS9P46781 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS9P46781 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS9P46781 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS9P46781 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS9P46781 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS9P46781 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS9P46781 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS9P46781 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS9P46781 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS9P46781 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS9P46781 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS9P46781 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS9P46781 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS9P46781 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS9P46781 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS9P46781 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS9P46781 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS9P46781 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS9P46781 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS9P46781 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS9P46781 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS9P46781 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS9P46781 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS9P46781 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS9P46781 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS9P46781 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS9P46781 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS9P46781 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS9P46781 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS9P46781 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS9P46781 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS9P46781 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS9P46781 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS9P46781 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPS9P46781 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS9P46781 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS9P46781 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS9P46781 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS9P46781 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS9P46781 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS9P46781 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS9P46781 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS9P46781 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS9P46781 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS9P46781 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS9P46781 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS9P46781 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS9P46781 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS9P46781 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS9P46781 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS9P46781 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS9P46781 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS9P46781 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS9P46781 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS9P46781 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS9P46781 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS9P46781 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS9P46781 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS9P46781 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS9P46781 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS9P46781 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS9P46781 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS9P46781 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS9P46781 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS9P46781 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS9P46781 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS9P46781 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS9P46781 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS9P46781 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS9P46781 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS9P46781 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS9P46781 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS9P46781 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS9P46781 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms