Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
RANGAP1P46060 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
RANGAP1P46060 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
RANGAP1P46060 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms