Protein–RNA interactions for Protein: P31321

PRKAR1B, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1BP31321 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAR1BP31321 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAR1BP31321 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAR1BP31321 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms