Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD6P30203 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD6P30203 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD6P30203 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD6P30203 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD6P30203 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CD6P30203 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD6P30203 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD6P30203 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD6P30203 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD6P30203 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD6P30203 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD6P30203 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD6P30203 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD6P30203 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD6P30203 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD6P30203 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD6P30203 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD6P30203 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD6P30203 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD6P30203 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CD6P30203 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD6P30203 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD6P30203 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD6P30203 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD6P30203 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD6P30203 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD6P30203 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD6P30203 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD6P30203 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD6P30203 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD6P30203 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD6P30203 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD6P30203 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD6P30203 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD6P30203 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD6P30203 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD6P30203 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD6P30203 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD6P30203 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD6P30203 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD6P30203 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD6P30203 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD6P30203 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD6P30203 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD6P30203 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD6P30203 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD6P30203 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD6P30203 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD6P30203 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD6P30203 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD6P30203 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD6P30203 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD6P30203 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD6P30203 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD6P30203 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD6P30203 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD6P30203 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CD6P30203 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD6P30203 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD6P30203 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD6P30203 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CD6P30203 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD6P30203 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CD6P30203 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD6P30203 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD6P30203 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD6P30203 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD6P30203 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD6P30203 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD6P30203 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD6P30203 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD6P30203 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD6P30203 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD6P30203 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD6P30203 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD6P30203 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD6P30203 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD6P30203 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD6P30203 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD6P30203 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD6P30203 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD6P30203 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD6P30203 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD6P30203 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD6P30203 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD6P30203 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD6P30203 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms