Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP1P28562 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP1P28562 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms