Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFSF4P23510 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNFSF4P23510 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNFSF4P23510 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms