Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RXRAP19793 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RXRAP19793 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RXRAP19793 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RXRAP19793 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RXRAP19793 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RXRAP19793 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RXRAP19793 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RXRAP19793 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RXRAP19793 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RXRAP19793 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RXRAP19793 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RXRAP19793 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RXRAP19793 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RXRAP19793 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RXRAP19793 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RXRAP19793 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RXRAP19793 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RXRAP19793 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RXRAP19793 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RXRAP19793 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RXRAP19793 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RXRAP19793 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RXRAP19793 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RXRAP19793 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RXRAP19793 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RXRAP19793 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RXRAP19793 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RXRAP19793 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RXRAP19793 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RXRAP19793 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RXRAP19793 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RXRAP19793 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RXRAP19793 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RXRAP19793 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RXRAP19793 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RXRAP19793 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RXRAP19793 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RXRAP19793 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RXRAP19793 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RXRAP19793 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RXRAP19793 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RXRAP19793 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RXRAP19793 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RXRAP19793 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RXRAP19793 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RXRAP19793 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RXRAP19793 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RXRAP19793 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RXRAP19793 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RXRAP19793 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RXRAP19793 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RXRAP19793 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RXRAP19793 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RXRAP19793 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RXRAP19793 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RXRAP19793 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RXRAP19793 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RXRAP19793 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RXRAP19793 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RXRAP19793 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RXRAP19793 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RXRAP19793 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RXRAP19793 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RXRAP19793 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RXRAP19793 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RXRAP19793 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RXRAP19793 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RXRAP19793 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RXRAP19793 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RXRAP19793 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RXRAP19793 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RXRAP19793 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RXRAP19793 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RXRAP19793 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RXRAP19793 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RXRAP19793 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
RXRAP19793 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RXRAP19793 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RXRAP19793 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RXRAP19793 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RXRAP19793 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RXRAP19793 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RXRAP19793 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RXRAP19793 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RXRAP19793 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RXRAP19793 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms