Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD58P19256 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD58P19256 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD58P19256 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD58P19256 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD58P19256 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD58P19256 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CD58P19256 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD58P19256 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD58P19256 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD58P19256 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD58P19256 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD58P19256 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD58P19256 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CD58P19256 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD58P19256 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD58P19256 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CD58P19256 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD58P19256 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD58P19256 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD58P19256 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD58P19256 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD58P19256 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD58P19256 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CD58P19256 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD58P19256 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD58P19256 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CD58P19256 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CD58P19256 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD58P19256 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD58P19256 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD58P19256 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD58P19256 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD58P19256 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD58P19256 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD58P19256 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD58P19256 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CD58P19256 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD58P19256 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD58P19256 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD58P19256 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD58P19256 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CD58P19256 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CD58P19256 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD58P19256 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD58P19256 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD58P19256 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD58P19256 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD58P19256 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD58P19256 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD58P19256 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CD58P19256 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD58P19256 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD58P19256 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD58P19256 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD58P19256 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD58P19256 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD58P19256 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD58P19256 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD58P19256 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD58P19256 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD58P19256 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD58P19256 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD58P19256 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD58P19256 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD58P19256 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD58P19256 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD58P19256 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD58P19256 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD58P19256 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD58P19256 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD58P19256 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CD58P19256 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD58P19256 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD58P19256 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD58P19256 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD58P19256 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD58P19256 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD58P19256 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD58P19256 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD58P19256 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD58P19256 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD58P19256 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD58P19256 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD58P19256 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD58P19256 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD58P19256 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD58P19256 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD58P19256 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CD58P19256 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD58P19256 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD58P19256 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD58P19256 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CD58P19256 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD58P19256 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD58P19256 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CD58P19256 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD58P19256 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD58P19256 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD58P19256 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms