Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL17P18621 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL17P18621 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL17P18621 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL17P18621 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL17P18621 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL17P18621 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL17P18621 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL17P18621 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL17P18621 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL17P18621 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL17P18621 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL17P18621 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL17P18621 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL17P18621 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL17P18621 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL17P18621 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL17P18621 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL17P18621 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL17P18621 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL17P18621 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL17P18621 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL17P18621 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL17P18621 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL17P18621 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL17P18621 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL17P18621 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL17P18621 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL17P18621 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL17P18621 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL17P18621 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL17P18621 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL17P18621 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL17P18621 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL17P18621 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL17P18621 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL17P18621 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL17P18621 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL17P18621 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL17P18621 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL17P18621 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL17P18621 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL17P18621 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL17P18621 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL17P18621 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL17P18621 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL17P18621 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL17P18621 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL17P18621 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL17P18621 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL17P18621 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL17P18621 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL17P18621 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL17P18621 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL17P18621 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL17P18621 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL17P18621 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL17P18621 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL17P18621 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL17P18621 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL17P18621 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL17P18621 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL17P18621 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL17P18621 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL17P18621 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL17P18621 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL17P18621 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL17P18621 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL17P18621 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL17P18621 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL17P18621 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL17P18621 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL17P18621 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL17P18621 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL17P18621 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL17P18621 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL17P18621 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL17P18621 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL17P18621 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPL17P18621 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPL17P18621 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPL17P18621 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL17P18621 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL17P18621 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL17P18621 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL17P18621 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL17P18621 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL17P18621 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL17P18621 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL17P18621 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL17P18621 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL17P18621 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL17P18621 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL17P18621 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL17P18621 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL17P18621 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL17P18621 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL17P18621 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL17P18621 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL17P18621 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms