Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GATA1P15976 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GATA1P15976 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GATA1P15976 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GATA1P15976 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GATA1P15976 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GATA1P15976 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GATA1P15976 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GATA1P15976 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATA1P15976 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATA1P15976 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATA1P15976 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATA1P15976 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATA1P15976 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GATA1P15976 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GATA1P15976 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATA1P15976 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATA1P15976 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATA1P15976 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATA1P15976 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATA1P15976 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATA1P15976 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATA1P15976 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GATA1P15976 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATA1P15976 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATA1P15976 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GATA1P15976 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATA1P15976 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATA1P15976 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATA1P15976 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATA1P15976 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATA1P15976 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATA1P15976 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GATA1P15976 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GATA1P15976 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GATA1P15976 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GATA1P15976 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GATA1P15976 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GATA1P15976 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA1P15976 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA1P15976 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA1P15976 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA1P15976 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA1P15976 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA1P15976 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GATA1P15976 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA1P15976 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA1P15976 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA1P15976 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA1P15976 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA1P15976 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA1P15976 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA1P15976 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA1P15976 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA1P15976 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GATA1P15976 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GATA1P15976 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATA1P15976 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATA1P15976 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATA1P15976 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GATA1P15976 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms