Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM1P13164 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFITM1P13164 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms