Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGAMP11215 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGAMP11215 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms