Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP2CP0DJJ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SRGAP2CP0DJJ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRGAP2CP0DJJ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms