Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
UBBP0CG47 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UBBP0CG47 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms