Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC159P0C7I6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC159P0C7I6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC159P0C7I6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms