Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRB1P04280 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRB1P04280 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRB1P04280 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRB1P04280 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRB1P04280 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRB1P04280 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRB1P04280 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRB1P04280 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRB1P04280 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRB1P04280 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRB1P04280 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRB1P04280 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRB1P04280 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRB1P04280 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRB1P04280 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRB1P04280 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRB1P04280 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRB1P04280 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRB1P04280 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRB1P04280 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRB1P04280 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRB1P04280 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRB1P04280 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRB1P04280 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRB1P04280 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRB1P04280 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRB1P04280 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRB1P04280 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRB1P04280 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB1P04280 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB1P04280 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB1P04280 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB1P04280 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB1P04280 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB1P04280 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB1P04280 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB1P04280 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB1P04280 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB1P04280 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRB1P04280 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRB1P04280 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRB1P04280 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRB1P04280 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRB1P04280 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRB1P04280 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRB1P04280 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRB1P04280 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRB1P04280 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRB1P04280 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRB1P04280 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRB1P04280 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRB1P04280 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRB1P04280 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRB1P04280 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRB1P04280 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRB1P04280 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRB1P04280 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRB1P04280 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRB1P04280 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRB1P04280 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRB1P04280 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRB1P04280 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRB1P04280 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRB1P04280 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRB1P04280 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRB1P04280 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRB1P04280 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRB1P04280 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRB1P04280 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRB1P04280 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRB1P04280 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRB1P04280 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRB1P04280 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRB1P04280 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRB1P04280 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRB1P04280 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRB1P04280 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRB1P04280 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRB1P04280 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRB1P04280 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRB1P04280 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRB1P04280 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRB1P04280 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRB1P04280 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRB1P04280 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRB1P04280 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRB1P04280 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRB1P04280 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRB1P04280 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRB1P04280 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRB1P04280 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRB1P04280 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRB1P04280 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRB1P04280 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRB1P04280 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRB1P04280 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRB1P04280 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRB1P04280 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRB1P04280 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms