Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP3BO95985 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP3BO95985 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms