Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNAPINO95295 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNAPINO95295 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNAPINO95295 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms