Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNDBP1O95273 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNDBP1O95273 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNDBP1O95273 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNDBP1O95273 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1O95273 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNDBP1O95273 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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