Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSO75390 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSO75390 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSO75390 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSO75390 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSO75390 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSO75390 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSO75390 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSO75390 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSO75390 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSO75390 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSO75390 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSO75390 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSO75390 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSO75390 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSO75390 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSO75390 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSO75390 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSO75390 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSO75390 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSO75390 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSO75390 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSO75390 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSO75390 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSO75390 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSO75390 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSO75390 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSO75390 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSO75390 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSO75390 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSO75390 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSO75390 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSO75390 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSO75390 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSO75390 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSO75390 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSO75390 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSO75390 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSO75390 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSO75390 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSO75390 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSO75390 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSO75390 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSO75390 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSO75390 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSO75390 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSO75390 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSO75390 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSO75390 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSO75390 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSO75390 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSO75390 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSO75390 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSO75390 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSO75390 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSO75390 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSO75390 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSO75390 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSO75390 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSO75390 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSO75390 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSO75390 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSO75390 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSO75390 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSO75390 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSO75390 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSO75390 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSO75390 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSO75390 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSO75390 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSO75390 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSO75390 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSO75390 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSO75390 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSO75390 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSO75390 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSO75390 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSO75390 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSO75390 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSO75390 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSO75390 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSO75390 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSO75390 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSO75390 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSO75390 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSO75390 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSO75390 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSO75390 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSO75390 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSO75390 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSO75390 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSO75390 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSO75390 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSO75390 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSO75390 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSO75390 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSO75390 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSO75390 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSO75390 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSO75390 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms