Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DHX16O60231 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DHX16O60231 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DHX16O60231 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DHX16O60231 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DHX16O60231 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DHX16O60231 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
DHX16O60231 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
DHX16O60231 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DHX16O60231 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DHX16O60231 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DHX16O60231 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DHX16O60231 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DHX16O60231 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DHX16O60231 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DHX16O60231 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DHX16O60231 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DHX16O60231 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX16O60231 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX16O60231 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX16O60231 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX16O60231 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX16O60231 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX16O60231 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX16O60231 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX16O60231 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX16O60231 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX16O60231 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX16O60231 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX16O60231 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX16O60231 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DHX16O60231 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DHX16O60231 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DHX16O60231 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DHX16O60231 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DHX16O60231 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DHX16O60231 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DHX16O60231 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DHX16O60231 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DHX16O60231 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DHX16O60231 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DHX16O60231 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DHX16O60231 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DHX16O60231 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DHX16O60231 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DHX16O60231 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DHX16O60231 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DHX16O60231 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DHX16O60231 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DHX16O60231 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DHX16O60231 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX16O60231 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX16O60231 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX16O60231 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX16O60231 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX16O60231 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX16O60231 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX16O60231 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX16O60231 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX16O60231 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX16O60231 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX16O60231 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX16O60231 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX16O60231 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX16O60231 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX16O60231 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DHX16O60231 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DHX16O60231 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DHX16O60231 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DHX16O60231 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DHX16O60231 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX16O60231 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX16O60231 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX16O60231 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX16O60231 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX16O60231 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX16O60231 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX16O60231 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX16O60231 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DHX16O60231 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DHX16O60231 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DHX16O60231 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DHX16O60231 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DHX16O60231 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DHX16O60231 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DHX16O60231 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DHX16O60231 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DHX16O60231 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DHX16O60231 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DHX16O60231 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DHX16O60231 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DHX16O60231 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DHX16O60231 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX16O60231 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX16O60231 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX16O60231 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX16O60231 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX16O60231 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DHX16O60231 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DHX16O60231 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms