Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP290O15078 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP290O15078 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP290O15078 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP290O15078 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CEP290O15078 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP290O15078 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP290O15078 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP290O15078 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP290O15078 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP290O15078 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CEP290O15078 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CEP290O15078 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CEP290O15078 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CEP290O15078 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP290O15078 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP290O15078 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP290O15078 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP290O15078 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP290O15078 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CEP290O15078 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CEP290O15078 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CEP290O15078 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CEP290O15078 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP290O15078 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CEP290O15078 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP290O15078 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP290O15078 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP290O15078 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP290O15078 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CEP290O15078 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP290O15078 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP290O15078 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP290O15078 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP290O15078 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP290O15078 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP290O15078 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP290O15078 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP290O15078 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP290O15078 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP290O15078 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP290O15078 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP290O15078 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP290O15078 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP290O15078 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP290O15078 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP290O15078 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP290O15078 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CEP290O15078 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP290O15078 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP290O15078 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CEP290O15078 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CEP290O15078 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CEP290O15078 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP290O15078 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP290O15078 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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