Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAD1O00515 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAD1O00515 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAD1O00515 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAD1O00515 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LAD1O00515 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAD1O00515 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAD1O00515 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAD1O00515 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAD1O00515 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAD1O00515 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAD1O00515 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAD1O00515 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAD1O00515 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAD1O00515 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAD1O00515 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAD1O00515 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAD1O00515 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAD1O00515 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAD1O00515 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAD1O00515 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAD1O00515 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAD1O00515 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAD1O00515 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAD1O00515 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAD1O00515 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAD1O00515 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAD1O00515 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAD1O00515 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAD1O00515 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAD1O00515 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAD1O00515 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAD1O00515 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAD1O00515 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAD1O00515 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAD1O00515 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAD1O00515 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAD1O00515 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAD1O00515 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAD1O00515 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LAD1O00515 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAD1O00515 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAD1O00515 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAD1O00515 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAD1O00515 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAD1O00515 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAD1O00515 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAD1O00515 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAD1O00515 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAD1O00515 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAD1O00515 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAD1O00515 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAD1O00515 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAD1O00515 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAD1O00515 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAD1O00515 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAD1O00515 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAD1O00515 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LAD1O00515 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAD1O00515 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAD1O00515 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LAD1O00515 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAD1O00515 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAD1O00515 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LAD1O00515 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAD1O00515 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAD1O00515 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAD1O00515 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAD1O00515 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAD1O00515 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAD1O00515 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAD1O00515 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAD1O00515 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAD1O00515 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAD1O00515 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAD1O00515 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LAD1O00515 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAD1O00515 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAD1O00515 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAD1O00515 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAD1O00515 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAD1O00515 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAD1O00515 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAD1O00515 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LAD1O00515 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAD1O00515 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LAD1O00515 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAD1O00515 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAD1O00515 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAD1O00515 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAD1O00515 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAD1O00515 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAD1O00515 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAD1O00515 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAD1O00515 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAD1O00515 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAD1O00515 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAD1O00515 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAD1O00515 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAD1O00515 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms