Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN6O00399 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCTN6O00399 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN6O00399 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms