Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF3FO00303 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3FO00303 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF3FO00303 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms