Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BML4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BML4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BML4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BML4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BML4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BML4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BML4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BML4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BML4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BML4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BML4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BML4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BML4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BML4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BML4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BML4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BML4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BML4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BML4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BML4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BML4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BML4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BML4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BML4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BML4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BML4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BML4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BML4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BML4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BML4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BML4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BML4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BML4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BML4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3BML4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3BML4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3BML4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BML4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BML4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BML4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BML4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BML4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BML4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BML4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BML4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BML4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BML4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BML4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BML4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BML4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BML4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BML4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BML4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BML4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BML4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BML4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BML4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BML4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BML4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BML4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BML4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BML4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H3BML4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BML4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BML4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BML4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BML4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BML4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BML4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BML4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BML4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BML4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BML4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BML4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BML4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BML4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BML4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BML4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BML4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BML4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BML4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BML4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BML4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BML4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BML4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BML4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms