Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms