Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGTLC3B5MD39 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGTLC3B5MD39 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GGTLC3B5MD39 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGTLC3B5MD39 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGTLC3B5MD39 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGTLC3B5MD39 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GGTLC3B5MD39 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGTLC3B5MD39 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GGTLC3B5MD39 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms