Protein–RNA interactions for Protein: A6NLI5

TRIM64C, Putative tripartite motif-containing protein 64C, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64CA6NLI5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM64CA6NLI5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM64CA6NLI5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM64CA6NLI5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms