Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC160A6NGH7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC160A6NGH7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC160A6NGH7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC160A6NGH7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms