Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A0D9SFI3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A0D9SFI3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A0D9SFI3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A0D9SFI3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A0D9SFI3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A0D9SFI3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A0D9SFI3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A0D9SFI3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A0D9SFI3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A0D9SFI3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A0D9SFI3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A0D9SFI3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A0D9SFI3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms