Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms