Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA4Q9UN74 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA4Q9UN74 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA4Q9UN74 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHA4Q9UN74 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA4Q9UN74 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA4Q9UN74 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA4Q9UN74 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms