Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACSL6Q9UKU0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSL6Q9UKU0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACSL6Q9UKU0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACSL6Q9UKU0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms