Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERG28Q9UKR5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERG28Q9UKR5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms