Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF3C4Q9UKN8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C4Q9UKN8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF3C4Q9UKN8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms