Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC40.15■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
TNIKQ9UKE5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
TNIKQ9UKE5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40.07■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.02■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
TNIKQ9UKE5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TNIKQ9UKE5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TNIKQ9UKE5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms