Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DKK3Q9UBP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DKK3Q9UBP4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DKK3Q9UBP4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms