Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COX16Q9P0S2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COX16Q9P0S2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COX16Q9P0S2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms