Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PODXL2Q9NZ53 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PODXL2Q9NZ53 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PODXL2Q9NZ53 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PODXL2Q9NZ53 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PODXL2Q9NZ53 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms