Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXI6

RNF186, RING finger protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF186Q9NXI6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF186Q9NXI6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF186Q9NXI6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF186Q9NXI6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF186Q9NXI6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF186Q9NXI6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF186Q9NXI6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF186Q9NXI6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF186Q9NXI6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF186Q9NXI6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF186Q9NXI6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF186Q9NXI6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF186Q9NXI6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF186Q9NXI6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms