Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCFC1R1Q9NWW0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCFC1R1Q9NWW0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HCFC1R1Q9NWW0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HCFC1R1Q9NWW0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms