Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNGB3Q9NQW8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGB3Q9NQW8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNGB3Q9NQW8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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