Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM10Q9NQV6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM10Q9NQV6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM10Q9NQV6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM10Q9NQV6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM10Q9NQV6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM10Q9NQV6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM10Q9NQV6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM10Q9NQV6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM10Q9NQV6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM10Q9NQV6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM10Q9NQV6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM10Q9NQV6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM10Q9NQV6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM10Q9NQV6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM10Q9NQV6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM10Q9NQV6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM10Q9NQV6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM10Q9NQV6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM10Q9NQV6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms