Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPRD1BQ9NQG5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms