Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PARD6AQ9NPB6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARD6AQ9NPB6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PARD6AQ9NPB6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.8 ms