Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZCCHC17Q9NP64 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZCCHC17Q9NP64 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZCCHC17Q9NP64 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZCCHC17Q9NP64 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms