Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SP110Q9HB58 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP110Q9HB58 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP110Q9HB58 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP110Q9HB58 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms