Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
UPF2Q9HAU5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UPF2Q9HAU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UPF2Q9HAU5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms